中华人民共和国福建海事局为正局级建制，隶属交通运输部，下辖一个副局级建制厦门海事局、六个正处级建制分支海事局（宁德、福州、莆田、平潭、泉州、漳州海事局）、一个正处级建制通信中心和一个正处级建制服务中心。
| 地址： 福建省福州市西二环南路116号 | 邮编： 350004 |
| 区号： 0591 | 办公室电话： 83838301 | 办公室传真： 83838302 |
| 搜救应急值班电话： 83838801 | 搜救应急值班传真： 83838820 |
内设机构
| 处室名称 | 电话 | 传真 |
|---|
| 办公室 | 83838301 | 83838302 |
| 法规规范处（执法督察处） | 83838876 | 83838890 |
| 综合计划处 | 83838330 | - |
| 指挥中心（搜救中心办公室） | 83838801 | 83838820 |
| 通航管理处 | 83838865 | 83838817 |
| 船舶监督处 | 83838862 | 83838821 |
| 船员管理处 | 88331207 | 83838830 |
| 危管防污处 | 88331205 | 83836982 |
| 安全管理处 | 83838857 | 83838310 |
| 基建装备处 | 83838332 | 83838335 |
| 科技信息处 | 83838372 | - |
| 审计处 | 83831203 | 83836790 |
| 宣传处 | 83830223 | 83838319 |
| 纪检办公室 | 83802903 | 83838326 |
| 直属机关党委办公室（工会办公室） | 88331201 | - |
| 船员考试中心 | 88331202 | 83836950 |
分支机构
| 机构名称 | 地址 | 邮编 | 搜救值班电话 | 举报电话 | 办公室电话 | 办公室传真 |
|---|
| 厦门海事局 | 厦门市海沧区海沧大道19号 | 361026 | 0592-6895123 | 0592-6895281 | 0592-6895299 | 0592-6895231 |
| 福州海事局 | 福州市马尾区儒江西路50号大德广场A座9层 | 350015 | 0591-83684018 | 0591-83996238 | 0591-83683948 | 0591-83684028 |
| 泉州海事局 | 泉州市晋江市文景路100号海事大厦 | 362200 | 0595-22565013 | 0595-22565800 | 0595-22590820 | 0595-28080800 |
| 宁德海事局 | 宁德市蕉城南路121号 | 352100 | 0593-2969113 | 0593-2929551 | 0593-2929371 | 0593-2929373 |
| 莆田海事局 | 莆田市城厢区霞林街道永乐路128号 | 351100 | 0594-2519516 | 0594-2519510 | 0594-2519506 | 0594-2519520 |
| 漳州海事局 | 漳州招商局开发区招商大道77号 | 363105 | 0596-6856830 | 0596-6856633 | 0596-6856833 | 0596-6856655 |
| 平潭海事局 | 平潭综合实验区金井大道东段26号 | 350400 | 0591-88770130 | 0591-88770155 | 0591-88770106 | 0591-88770120 |
政务中心
| 机构名称 | 地址 | 邮编 | 电话 | 传真 | 办公时间 |
|---|
| 福建海事局政务中心 | 福州市台江区工业路51号1号楼2层 | 350004 | 0591-83836987、83836910 | 0591-83272392 | 0830-1200；1430-1730 |
| 厦门海事局政务中心 | 厦门市海沧大道19号二楼 | 361026 | 0592-6895184 | 0592-6895029 | 0830-1200；1400-1700 |
| 福州海事局政务中心 | 福州市马尾区儒江西路50号大德广场A座9层 | 350015 | 0591-83982667 | 0591-83996028 | 0830-1150；1330-1620 |
| 泉州海事局政务中心 | 泉州市晋江市文景路100号海事大楼二楼 | 362200 | 0595-28080837 | 0595-28080830 | 0830-1200；1400-1700 |
| 宁德海事局政务中心 | 宁德市蕉城区蕉城南路121号海事大楼一层大厅 | 352100 | 0593-2997997 | 0593-2929383 | 0830-1200；1430-1730 |
| 莆田海事局政务中心 | 莆田市城厢区霞林街道永乐路128号 | 351100 | 0594-2519515 | 0594-2506169 | 0830-1200；1430-1730 |
| 漳州海事局政务中心 | 漳州市招商局漳州开发区招商大道77号 | 363105 | 0596-6856232 | 0596-6856621 | 0830-1200；1345-1645 |
| 平潭海事局政务中心 | 平潭综合实验区和平大道辅路平潭口岸科技中心 | 350400 | 0591-88770135 | 0591-88770120 | 0830-1200；1430-1730 |
其他机构
| 机构名称 | 电话 | 传真 |
|---|
| 后勤管理中心 | 0591-83813629 | 0591-83836950 |
